通州区中医医院是一所集医疗、科研、教学、预防保健四位一体的中医综合性医院，是北京市中医学校的教学医院，承担主要的临床教学实习任务。全院共有职工245人，专业技术人员220人，其中高级职称21人，中级职称72人，研究生5人，目前医院知识结构合理，梯队基本形成。全院固定资产3000万元，专业设备600余台件（套），全身CT、彩色B超、全自动生化分析仪、运动平板等已在临床、科研和教学工作中发挥作用。中风、骨伤、胸痹、肛肠是该院的重点科室，结石、皮肤、椎间盘专业症是该院的特色科室，中风专业组配合《脑功能再健法》采用中药熏、洗、泡、针灸、按摩等综合治疗，有效地减轻中风病人神经功能缺损，增强肢体运动功能，使90%的中风病人恢复生活自理能力，《脑中风功能再健法的临床研究》获通州区科技进步二等奖，《加味抵挡汤治疗缺血脑中风临床观察》获通州区科技进步一等奖、北京市科技进步三等奖；骨伤科处理急症骨伤能力可达到市级医院水平；肛肠科多年来采用中药注射、结扎、剥扎配合远红外线凝结现代医疗手段治疗肛肠病人2万余人，效果显著。结石科的体外冲击泼碎石加上传统的三联法，配合本院的中药，可使绝大多数的病人痛苦小的将秘尿系和胆囊结石排出，椎间盘科采用现代切吸疗法可达到创伤小、痛苦少、费用低的满意疗效。

北京市通州区中医医院自1994年遵循卫生事业的内在规律，主动适应卫生改革形势，建立宏观调控有力，微观运行富有生机的新举措----综合目标管理责任制，在人事制度、奖金分配制度和质量考评工作中取得成绩，成为通州区卫生改革的试点单位，医院的业务量逐年增加，从1993年的日门诊量300人次上升到2001年的700人次，年住院病人从1993年的2500人次上升到2001年的3000人次，年业务收从1993年的747万元上升到2001年的3700万元，人均创收达12万元。1996年通过国家中医管理局验收，成为通州区二级甲等医院，被评为通州区和首都精神文明单位，物价计量信得过单位，北京市行业作风文明窗口。鉴于医院发展建设较快，医院环境不能满足通州百姓的中医医疗需求。经区政府批准，拟将在长安街延长线、通州区河东新城筹建一所占地1000亩、建筑面积30000平方米，能容纳400张病床，年门诊量达30万人次，收住病人6000人次，具有现代化、科学化、人文化、湖光山色、花香秀美的医、教、研、防、保健为一体的中医综合医院。为2008年奥运会做贡献。社区科最先在通州区成立家庭病房和流动医院，并推出五个24小时服务：即24小时急诊出诊24小时热线咨询24小时急救车接送病人24小时电脑查询各种收费标准及医疗指南24小时便民药房取药，流动医院深入农村、集市、城镇广场a民小区义诊、宣传卫生防病、医疗保健知识。